目的 了解西藏口岸蝇类携带病原体情况,为口岸卫生检疫执法工作提供技术支持。方法 对2017年5-10月在西藏自治区拉萨贡嘎国际机场口岸、吉隆口岸、亚东口岸采集到的蝇类进行病原体检测,利用微生物分离纯培养技术及细菌16S rRNA基因序列鉴定和生理生化鉴定技术对蝇类样本进行细菌学检测,利用RT-PCR技术检测蝇类携带病毒情况。结果 从蝇类样本中分离出粪肠球菌、蜂房哈夫尼亚菌、威斯康星米勒菌、大肠埃希菌、普通变形杆菌、耐久肠球菌等37种致病菌(条件致病菌)。病毒检测检出1例轮状病毒(A型)阳性,检出率为2.0%(1/50)。结论 蝇类携带大量细菌,有些还携带肠道病毒,可导致疾病在国境口岸传播的风险,卫生检疫机构应加强对国境口岸蝇类检测,防止传染病扩散。